HPV检查主要是针对HPV感染引起的下生殖道疾病进行筛查，如尖锐湿疣、宫颈癌等。目前对于HPV的检查项目有HPVDNA检测、细胞学检查挖空细胞、免疫组化检测HPV抗原、HPV抗体检测等。
HPVDNA检测是临床应用较广泛的检测方法，主要分为HPV分型检测及不分型检测。根据HPV引起宫颈癌的可能性，2012年国际癌症研究机构将其分为高危型、疑似高危型和低危型。前两者与宫颈癌及高级别外阴、阴道、宫颈鳞状上皮内病变相关，低危型与生殖器疣及低级别外阴、阴道、宫颈SIL相关。对于HPV的其他检测项目，包括细胞学检查挖空细胞、免疫组化检测HPV抗原、HPV抗体检测等，由于敏感性低、特异性差而临床较少应用。目前，国内多数地区仍将细胞学作为宫颈癌的主要初筛方案，由于细胞学的敏感性较差，可能存在宫颈管或转化区细胞取材不足，也会影响细胞学的检测结果。
对于HPV检查首选HPV分型，若高危型HPV检测阳性，建议进行阴道镜检查，若高危型HPV检测阴性，3年时重复联合筛查方案即液基细胞学加HPV分型检测联合筛查。
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