甲胎蛋白主要作为原发性肝癌的血清标志物，用于原发性肝癌的诊断以及疗效监测。
甲胎蛋白是一种糖蛋白，主要由胎儿的肝细胞和卵黄囊合成，甲胎蛋白在胎儿的血液循环具有较高的浓度，但是在胎儿出生以后，甲胎蛋白会下降，一般在出生2~3个月左右会被白蛋白代替，这时候血液中一般不会检出甲胎蛋白，甲胎蛋白与肝癌以及多种肿瘤的发生发展密切相关，在多种肿瘤中均可表现出较高的浓度，所以是一种肿瘤标志物。
甲胎蛋白升高也可能是其他疾病，比如肝炎、生殖系统疾病。良性肝病的甲胎蛋白含量一般为轻-中度升高。如果是恶性肿瘤导致的甲胎蛋白含量增多，会持续性升高，所以动态观察既可以鉴别良性和恶性的肝病，帮助早期诊断肝癌。
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