衣原体包涵体是衣原体在增殖的过程中，寄主细胞内形成一种蛋白质性质的病变结构，其在光学显微镜下可见，可为圆形、卵圆形或不定形，如果在受检样本中发现衣原体包涵体，提示存在衣原体感染的情况。
衣原体是一类专性真核细胞内寄生的原核细胞型微生物，常见致病性衣原体包括肺炎衣原体、沙眼衣原体等。衣原体中的肺炎衣原体主要经呼吸道进行传播，可导致人体出现咽炎、支气管炎和肺炎等疾病。沙眼衣原体可通过直接或间接接触传播，导致患者出现沙眼或包涵体性结膜炎。沙眼衣原体还可以经性接触传播，引起泌尿生殖系统感染。男性患者感染后可能会出现尿道炎、附睾炎、前列腺炎等，女性患者可能出现宫颈炎、尿道炎、不孕症和异位妊娠等疾病，如果在妊娠期感染沙眼衣原体，还可能会导致流产、早产、胎停等情况，经产道分娩时还可能会传染给新生儿。
检查时发现衣原体包涵体时，需进一步检查确诊是否感染衣原体，确诊后可使用阿奇霉素、阿莫西林、多西环素、红霉素以及左氧氟沙星等抗生素进行治疗，妊娠期女性感染可以在医生指导下使用阿奇霉素、红霉素等药物治疗。
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