一般对于厌氧菌感染的患者，如果是体表部位的厌氧菌感染，需要开放创口，如将创口切开引流，并且将脓液引出。
另外，局部注意用双氧水擦拭消毒之后，再用生理盐水或者蒸馏水冲洗，再用碘伏消毒覆盖无菌辅料或者创可贴。如果是感染炎症较重或者是特殊细菌的感染，此时除了上述的处理之外，还需要在高压氧舱内行高压氧治疗，一般对于厌氧菌或者特殊细菌的感染效果较好。
在输注抗生素的药物上，建议患者先取局部的分泌物，做细菌培养以及药敏试验，最好是根据药敏试验结果，再考虑应用敏感抗生素。一般可以选择甲硝唑类的抗生素，以及氨基糖甙类的抗生素，还有大环内酯类抗生素，还有万古霉素以及去甲万古霉素等抗菌药物，进行积极治疗。
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