谷氨酰转肽酶增高的原因，主要是由于谷氨酰转肽酶在肝内主要存在于肝内胆管上皮和肝细胞浆中，肝外胆管和肝内梗阻时就会造成管酰转肽酶排泄受阻，随胆汁反流入血，而致使血清中谷氨酰转肽酶升高。
除肝脏外，体内的肾、肺、睾丸、心、脑、肌肉等组织也都含有谷氨酰转肽酶。因此，出现肾盂肾炎、大叶性肺炎、乙型脑炎、心肌炎、胆囊炎、血吸虫病等都会造成谷氨酰转肽酶异常。药物过敏及药源性因素，或中毒性肝损伤等，也会造成谷氨酰转肽酶升高。妊娠期中毒症及妊娠期的急性脂肪肝时，甚至于正常妊娠时，谷氨酰转肽酶也会升高。
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