如果患者的肺部感染确诊为细菌感染或者是支原体感染时，使用莫西沙星是有效的，一般经过治疗1-2天后，就会出现明显的临床效果。但如果患者的肺炎是由于病毒引起时，使用莫西沙星是无效的。临床上提示为细菌感染的指标包括了白细胞、中性粒细胞、中性粒细胞百分比高于正常，C反应蛋白、降钙素原也会出现高于正常，上述检查结果证明是细菌性感染。如果患者的支原体抗体在近期出现了四倍以上升高，说明近期出现了支原体的感染。上述两种情况，使用莫西沙星是有效的。如果患者出现了白细胞的降低，病毒抗体阳性，而C反应蛋白、降钙素原、支原体抗体正常时，考虑为病毒性肺炎，使用莫西沙星是无效的。
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